Les expérimentations biologiques de l'Umbrella Corporation via le T-Virus ont fortement ébranlé Racoon City. Pour éviter plus de dommages collatéraux, le Gouvernement Américain a rayé la ville de la carte et soigneusement gommé toute trace d'activité de la société Umbrella.
6 ans après ces sanglants évènements, la fille du Président des Etats-Unis est victime d'un rapt et retenue captive quelque part en Europe, sans qu'aucun renseignement solide sur l'identité du ravisseur ni même une exigence de ce dernier ne soient connus. Il en incombe à l'agent très spécial Leon S. Kennedy de localiser, récupérer et ramener la petite Ashley au pays.